新型冠狀病毒疫情造成觀光產業非常大的衝擊，尤其旅宿業者首當其衝，臺南市市長黃偉哲自疫情開始3月初，指示市府相關單位超前部署，觀光旅遊局即針對旅宿業、觀光遊樂業、溫泉業分別辦理諮詢座談會，聆聽業界紓困相關需求，繼而立即成立輔導小組協助旅館商業同業公會、民宿文化發展協會及溫泉協會等申辦「交通部協助重大疫情影響觀光產業轉型培訓計畫」，截至109年4月30日4個公協會共計獲准核定7梯次共560人補助經費2100萬元，補貼每人每小時新臺幣158元之轉型培訓費，讓台南市觀光產業員工趁疫情期間加強專業知能，並邀請外縣市旅宿業者移地台南進行培訓及交流參訪，將台南旅宿特色經驗與全台旅宿業者分享學習，觀光旅遊局亦加碼致贈伴手禮，擴大參與產業類型。

為因應本市居家檢疫者，可能發生在台無固定居所，或因獨居無法自理生活，或因不適合與家人同住等情形，市府積極著手本市檢疫旅館整備工作，依據衛生福利部疾病管制署「COVID-19(武漢肺炎)」因應指引-防疫旅館設置及管理規定進行場地勘查與人員衛教，並獲得交通部觀光局配套的清潔消毒與防疫物資補助300萬元，協助購置防疫物資供防疫旅館使用，同時協助進行檢疫房間終期清消，另持續向中央爭取每日每房1000元之溫馨防疫旅館計畫補助，金額共計1305萬7000元，加碼獎勵檢疫旅館業者配合政府政策，目前計16家業者438房響應順利運作中，充足的居家檢疫量能，避免居家檢疫者流落在外，造成防疫缺口。同時另鼓勵旅宿業者推出居家檢疫家屬之「家人安心住」專案，獲36家業者1225房共襄盛舉。

在減輕業者營運負擔方面，觀光旅遊局積極輔導旅館業者申請交通部觀光局辦理必要營運負擔補貼申請，除108年地價稅及房屋稅二項各業者至少補貼20萬元外，亦配合財政稅務局宣導旅宿業針對部分停用範圍改按「非住家非營業用」課徵房屋稅，截至5月6日止計有23家旅館減免金額約260萬元；旅館員工薪資補貼部分，輔導業績衰退達五成以上之業者，補貼員工薪資每人每月薪資百分之四十。此外輔導一般民宿每家申請5萬元、好客民宿每家10萬元之紓困補貼。台糖尖山埤江南渡假村及頑皮世界野生動物園等二間觀光遊樂業，除皆已取得營運補貼20萬元，薪資補貼亦進行申請中。

觀光旅遊局郭貞慧局長表示，為鼓勵旅館業者利用疫期進行硬體修繕及建物結構安全評估，市府觀光旅遊局修正「臺南市政府觀光旅遊局旅館業品質提昇補助要點」補助金額上限提高為20萬元，自4月開放申請以來已，包括劍橋大飯店、F商旅及國妃鷹堡汽車旅館仁德館等逾20家旅館業者申請補助進行設備更新修繕，協助旅館業者利用此疫情期間提升服務品質，提升市場競爭力，期望提供來台南住宿的旅客煥然一新更優質的旅宿服務。